Сюжет фильма основан на одноимённой повести Колина Тьеле, которая уже была экранизирована Генри Сафраном в 1976 году. «Мой друг мистер Персиваль» стал его ремейком.

Актёр Дэвид Галпилил ранее сыграл роль Билла в оригинальном фильме Сафрана «Мальчик и океан», а в ленте «Мой друг мистер Персиваль» он появился в образе отца Билла.

Съёмки проходили в Южной Австралии. Большая часть съёмочного процесса проходила в максимальной близости к местам, где находились гнёзда пеликанов. Специально для съёмок было поймано пять птиц, которые прошли тщательную дрессировку. Актёр Финн Литтл, сыгравший в ленте роль юного Майкла, познакомился с птицами, когда им было всего несколько недель. Практический каждый день он общался с пеликанами и привыкал к ним, чтобы птицы не боялись довериться ему.

Хижину соорудили в студии в Аделаиде, административном центре штата Южная Австралия. Затем её разобрали, перевезли на территорию Куронга на юге штата и снова собрали. Сооружение было дважды «состарено», чтобы выглядеть так, каким оно было в 1959 и 2017 годах.

Создателям фильма хотелось снимать его в соответствии со сценарием в самую холодную и влажную часть года, так что актёрскому составу пришлось несладко.